Tokyo, 2099. Une faille temporelle perturbe la Toile de la vie et du destin. Les héros Marvel s'affrontent afin de réparer les dégâts causés par celle-ci. Menée par Peni Parker, une équipe tente de brancher la Toile dans le cyberspace pour la réparer, tandis que l'autre groupe, dirigé par Spider Man, souhaite se servir du Chronovium afin de la renforcer et de la laisser se réparer d'elle-même.