Août 415, Hypatie est massacrée dans la rue par des moines. A côté de son brasier, un mystérieux codex. Cet assassinat déclenche une succession de meurtres qui traversent les lieux et les époques pour punir ceux qui poursuivent le dessein de cette femme exceptionnelle. Juillet 2018 : Marie, jeune biologiste, est confrontée à des disparitions effroyables et s'interroge sur son propre rôle.