Alita é uma ciborgue que, depois de ser encontrada aos pedaços no lixão, foi reconstruída por Daisuke Ido, um técnico em cibernética e caçador guerreiro (um tipo de caçador de recompensas) nas horas vagas. A partir daí, os dois começam a desenvolver uma relação quase fraternal. Apesar de ter perdido sua memória, Alita está mais preocupada com o presente e passa a vivenciá-lo ao máximo, principalmente depois que descobre que Ido é um caçador. O primeiro volume da versão em e-book equivale à primeira metade da versão impressa em formato big e mostra o começo da história da androide e a primeira batalha da heroína contra Makaku, um ciborgue assassino viciado em endorfina. Para sustentar seu vício, Makaku tenta sugar o cérebro de quem aparece na sua frente. A luta não vai ser nada fácil, pois a garota logo descobre que Makaku é mais cruel do que ela imaginava.